Мы часто забываем, почему о святителе Петре говорят именно как о чудотворце Московском. Много чудес и исцелений происходило от его гроба. Его почитали как великого угодника Божия, молитвы которого имели большую силу. Многие чудеса святителя Петра описаны в известном житии святого, составленном святителем Киприаном. Другие же можем найти и в иных источниках.
Из «Сказаний о чудесах митрополита Петра, записанных любомудрецом Кифой».
1470 год. Также и я своими глазами видел и на собрании людском был, и с ними вместе дивился чудодейству святого. …При Великом князе Иване Васильевиче и при митрополите Филиппе, человек некий, в городе славный и очень богатый, именем Владимир Ховрин, имея раба некоего, у него же отроковица была лет шести или меньше, которая была слепа. И принесена была на преславную его память к раке источника неисчерпаемого чудес. Когда приложили ее к раке святого, сразу прозрела. И дали ей свечу, она же взяла, также и всех своих видела, всех ближних бывших в церкви. И возвестили всему собору церковному. Они же сказали митрополиту Филиппу. Митрополит же повелел звонить, и собрался народ, и пели канон молебный святому, и прославили Бога.
1408 год. …Марта месяца 11 день человек некий в великой болезни принесен был к цельбоносному гробу и, целуя раку, и с сокрушенным сердцем помолившись, также с иереем этого храма, в котором лежит тело, чудеса источая, как река, певшем молебен чудотворцу о нем, и исцеление получив, прославил Бога и угодника Его Петра митрополита.