10 июля 2006 года во время вечернего Богослужения в храм, через фреску Спасителя, изображенную под куполом, вошла молния и, пройдя по металическим цепям, на которых висело паникадило, вдруг ударила в деревянный иконостас, в икону над царскими вратами. После этого молния исчезла, как будто просто вошла в икону Пророка и Крестителя Господня Иоанна Предтечи.
В этот день никто из находящихся в храме не пострадал. В результате удара молнии нимбы святых, покрытые сусальным золотом, изменили цвет, что заметно и сейчас; больше всего это коснулось нимба святого Иоанна Предтечи, которого батюшка особо благодарил за спасение от “небесного огня”.
Это чудо свершилось на вечернем Богослужении под вторник – день, который Церковь в недельном круге Богослужений посвящает святому пророку Иоанну, – вскоре после дня празднования памяти Рождества Предтечи и Крестителя Господня Иоанна (7 июля по н. ст.).